Всегда ли ребенок был таким пугливым? Если не всегда, то нужно выяснять, что произвело на него такое сильное впечатление, что он не может оставаться один.
Были ли какие-либо серьезные заболевания у ребенка?
Какая атмосфера в семье, где он растет, какие отношения между родителями?
Все эти моменты нужно прояснять вместе со специалистом по детской психологии, к которому вам имеет смысл показать ребенка. Лучше это сделать в ближайшее время.